تتطلع وكالة كلية علوم وهندسة الحاسب للبحث العلمي والإبتكار الى ان يكون لها دورمتميز و ريادي في دعم وتطويربرامج الدراسات العليا وتطوير العملية التعليمية لإعداد كوادررائدة مزودة بالمهارات والمعارف و الخبرات، وتتطلع الوكالة أيضاً الى ان يكون لها دور متميز في دعم استحداث برامج نوعية للدراسات العليا معتمدة من مؤسسات وطنية وعالمية تواكب التطور التقني والمعلوماتي و تمثل ميزة تنافسية لتلبية احتياجات سوق العمل.

كما تسعى الوكالة الى ترسيخ قيم البحث العلمي والابتكار و تطوير المشاريع البحثية والابحاث العلمية المميزة في الكلية للمساهمه في إيجاد حلول للتحديات المعاصرة و لمواكبة التطورالتقني المحلي والعالمي وذلك من خلال تهيئة بيئة تعليمية وبحثية لإنتاج المعرفة واستثمارها، وأيضا من خلال توجيه البحث العلمي والإبتكار نحو المجالات التي تخدم القضايا الوطنية بما يحقق تطلعات وأهداف جامعة جدة ورؤية المملكة 2030.